Социјална инклузија у Федерацији Босне и Херцеговине је у надлежности Министарства рада и социјалне политике, које има неколико сектора који покривају социјалну инклузију према циљној групи или компетенцијама, док Министарство образовања и науке покрива социјалну инклузију у формалном образовању кроз различите секторе. Оба министарства су делегирала своје надлежности на кантонални ниво.
У Републици Српској, Министарство здравља и социјалне заштите задужено је за социјална питања. Министарство има Одјељење за социјалну, породичну и дјечију заштиту, које пружа подршку у изради политика за унапређење социјалне заштите дјеце и младих, као и подршку младима с инвалидитетом у оспособљавању за рад.
Влада Брчко Дистрикта има неколико одјељења која покривају социјалну инклузију у зависности од циљне групе и области дјеловања, као што су: Одјељење за расељена лица, избјеглице и стамбена питања, Одјељење за образовање и Одјељење за здравство и друге услуге.
Напори невладиних организација у области социјалне инклузије у Босна и Херцеговина видљиви су кроз пројекте који се проводе с различитим циљним групама.